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在使用PCR扩增目的基因片段的过程中，由于不清楚目的基因序列，并不能确定是否获得单一的PCR产物，要获得的目的片段，通常需要采用TA克隆的方法。
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相对定量 (mRNA表达量分析)：基因表达的研究一般采用相对定量的方法。相对定量法必须对样品的目的基因和内参基因同时分别进行定量，然后求出对于内参基因的目的基因的相对量。
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BSP法原理：用亚硫酸氢钠修饰处理基因组DNA，所有未发生甲基化的胞嘧啶（C）被转化为尿嘧啶（U）而甲基化的胞嘧啶则不变。
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