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FFPE样本保存久了，提出来的DNA还能用来NGS测序吗

作者：杭州联科生物技术股份有限公司 2015-07-16T09:56 (访问量:17416)

FFPE为福尔马林固定、石蜡包埋的（Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded，FFPE）的样本。这类病理样本包含珍贵且来源广泛的生物医学研究材料。由于甲醛固定样品会随机产生C-T转化，且FFPE样本在保存过程中会有核酸的损失，所以如何去除FFPE样本中产生的假阳性及提高FFPE样本中核酸的得率，如何处理样本及挖掘其中有效准确的信息成为现在研究的挑战。

QIAGEN 作为全球样本制备及分析纯化的领导者，针对以上两点为广大FFPE样本研究者提供了完美的解决方案：

脱蜡

纯化

下游NGS分析

数据解读

GeneRead DNA FFPE Kit采用基于硅胶模离心柱的优化实验方案，能够从福尔马林固定、石蜡包埋（FFPE）组织样本中纯化出高品质基因组DNA。由于胞嘧啶的脱氨作用所导致的C>T人为突变现象在二代测序技术中影响很大。此类人为突变由福尔马林固定以及样本老化所引发，会导致测序结果产生偏差。GeneRead FFPE纯化步骤中引入了酶促处理，能够消除此类人为突变，从而保证了基因组DNA的产量高、纯度好，特别适用于二代测序应用。

特点

试剂盒包含脱蜡液
采用优化的裂解液，可从FFPE样品中高效回收gDNA
酶促反应去除胞嘧啶脱氨产物
最大限度减少假阳性SNP检出风险
在DNA测序应用中获得出色结果
可在QIAcube全自动核酸纯化仪上自动运行

QuantiMIZE系统:

当然，还有很多研究者会提出：我的FFPE样品保存了有点久了，提出来的DNA 还能用吗？
QIAGEN为您提供FFPE样本质控：QuantiMIZE系统。

QuantiMIZE系统工作原理：

*只有PCR质控才能真实反映下游PCR的可能结果。

相关产品列表：

货号	产品名称	规格	备注
19093	Deparaffinization Solution (16 ml)	2*8 ml	脱蜡液
180134	GeneRead DNA FFPE Kit	50次	FFPE样本抽提DNA，减少人为C>T突变
180654	GeneRead DNA QuantiMIZE Assay Kit		FFPE样本DNA质控

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